产品说明
TGIRT-III RTnase具有依赖于DNA/RNA杂交链的反转录酶活性,能快速合成cDNA,该酶具有强的链转换活性(Switch)。因此该酶可用于tRNA、ncRNA、miRNA等核酸分子的同步逆转录和加接头(TGIRT template-switching reaction,用于TGIRT-Seq)。TGIRT-III RTnase具有极强的延伸性能,因此更易获得全长的cDNA。此外,该酶的强switch活性,使得可以利用RNA的5’端帽结构进行SMART建库(SAMRT-Seq)。反应温度为37-60°C,最佳反应温度为50°C。
本公司TGIRT-III Reverse Transcriptase是重组表达,并经多步纯化制备的重组蛋白。
活性定义
1活性单位指在50℃下, 1×TGIRT-III Reverse Transcriptase反应缓冲体系下,利用poly(rA)/oligo(dT)42作为底物,10 min内将10nmole dNTP掺入酸不溶性物质所需的酶量。
活性测定条件
1×TGIRT Buffer1:20 mM Tris-HCl(pH7.5),0.45 M NaCl,5 mM MgCl2。
1×TGIRT Buffer2:20 mM Tris-HCl (pH 7.5), 10 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT。
室温孵育30min后,加入2.5 μl的10 mM dNTP后,于50°C下反应30min。
失活
反应结束后,向反应体系中加入1μl的5N NaOH(终浓度0.25N),并置于95°C下加热3min,失活该酶。失活后加入1ul的5N HCl中和NaOH。
浓度:10 pmole/μl
保存条件:长期储存置于-20°C以下,可保存2年。
特点
Ø 比逆转录病毒逆转录酶更高的热稳定性,持续性和保真度,能够以高度结构化或修饰的RNA为模板,合成全长的端到端cDNA。
Ø 新的端对端模板转换活性,其能够在逆转录过程中连接RNA-seq或PCR接头,并且不再需要单独的RNA 3'-接头连接步骤。
Ø 不需要RNA连接酶,对模板量要求低,简化RNA-seq文库构建步骤,且更高效。
适用范围
Ø 确定RNA高级结构
Ø 长cDNA的合成
Ø 全基因组或靶向RNA结构分析
Ø 链特异性转录组分析
Ø 全细胞或无细胞转录组测序
Ø 非编码RNA转录组测序
Ø RIP-seq,HITS-CLIP,irCLIP and CRAC
Ø 通过高通量测序鉴定RNA碱基修饰
产品包装规格及组成
Component | AE0442A | AE0442B | AE0442C | AE0442D |
TGIRT-III RTnase(10pmol/ul) | 100ul | 500ul | 500ul×4 | 500ul×10 |
5×TGIRT Buffer 1 | 0.5ml | 1.0ml×2 | 5.0ml×2 | 5.0ml×5 |
5×TGIRT Buffer 2 | 0.5ml | 1.0ml×2 | 5.0ml×2 | 5.0ml×5 |
100mM DTT | 0.25ml | 1.2ml | 1.0ml×4 | 1.0ml×10 |
质量控制
经过严格的质控检测,确保该产品具有最高的活性和纯度。
反应Buffer
5×TGIRT Buffer1: 100mM Tris-HCl, pH7.5, 2.25M NaCl, 25mM MgCl2。
5×TGIRT Buffer2: 100mM Tris-HCl, pH7.5, 50mM NaCl, 50mM MgCl2, 5mM DTT。
酶贮存缓冲液
20 mM Tris-HCl (pH 7.5), 0.5 M KCl, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, and 50% glycerol。
注意事项
l 本酶为热稳定性酶,简单高温加热不能完全失活酶。
l 若需要反应结束后失活酶,应加入终止反应液,然后再加热失活酶,需考虑终止液对后续实验的影响。
l 终止液包括终浓度:0.2M NaOH、100mM EDTA、1%SDS等,若进行后续实验,建议终止液使用终浓度0.25M NaOH加热失活,并加入等量HCl中和NaOH。
使用实例:
1)按下表配制反应体系
反应组分 | 体积或浓度 |
5×Buffer | 4ul |
100mM DTT | 2ul |
底物:退火的DNA引物/RNA模板* | Xul |
酶(10p/µl) | 1-2ul |
H2O | Yul |
总体积 | 20ul |
2)室温孵育 30min
3)加入 2.5 μl 的 10mM dNTP 后,于 50°C条件下反应 10-60min(通常 15min)
4)反应结束后,向反应体系中加入 1μl 的 5N NaOH, 95°C加热 3min,失活酶。失活后加入 5N HCl 中和碱。
5)尿素变性PAGE电泳或琼脂糖电泳检测酶切产物,或按实验目的进行后续操作。
* RNA加入量1-100ng
警告: 本产品仅限科研实验使用,临床应用安全性和有效性未鉴定,不可用于医疗临床诊断。